第二讲序列比对练习题.ppt
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1、第二讲序列比对练习题,辨析题,同源的序列一定具有显著的相似性。,错。随着进化距离的增加,同源序列的相似性逐渐降低,直至没有显著的相似性。,辨析题,显著相似的序列一定是同源的。,错。显著相似的序列可能是进化上同源的,也可能是不同源但是功能相关。,总结:一般情况下,同源序列是显著相似的,显著相似序列是同源的,但是也存在特殊情况。,辨析题,已知两条序列具有70%的相似性,则它们具有70%的同源性。,错。同源性是定性描述,要么是要么不是,不可能是一个百分比。相似性和一致性则是以百分比的形式表示。,辨析题,一条100个残基长的序列,发生50次突变后,与原序列的一致性是50%。,错。因为突变可以在相同的位
2、点多次发生,所以与原序列的一致性应大于或等于50%。,选择题,Smith-Waterman算法与FASTA算法相比,_。A.灵敏性更强,速度更快。B.灵敏性更弱,速度更快。C.灵敏性更弱,速度更慢。D.灵敏性更强,速度更慢。,D,填空题,在DNA序列中,N代表_;在蛋白质序列中,N代表_。,未知核苷酸天冬酰胺,简答题,要比较两条远缘的序列,应该使用以下那一组矩阵?(1)若使用PAM矩阵,应选择PAM10还是PAM250?(2)若使用BLOSUM矩阵,应选择BLOSUM45还是BLOSUM80?,(1)PAM250(2)BLOSUM45,简答题,同源,直系同源,旁系同源分别是什么意思?,简答题,(1)若对人和线虫的进化关系进行分析,应该使用核苷酸序列还是氨基酸序列?(2)若想比较黄色人种和白色人种的特点,应该使用核苷酸序列还是氨基酸序列?(3)若想研究两个基因是否具有相似的功能,应该使用核苷酸序列还是氨基酸序列?,(1)氨基酸适用于亲缘较远的分化分析。(2)核苷酸适用于种内多态性分析。(3)氨基酸与功能性联系更密切。,计算题,使用Needle-Wunsch算法比较序列:CKCPRM与CLCRMA,
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- 第二 序列 练习题
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